Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A4Q6AI14 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms