Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms