Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms