Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4DIPQ5VU43 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DIPQ5VU43 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms