Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms