Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO4Q5TGY1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms