Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBAP2Q5T6F2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBAP2Q5T6F2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms