Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms