Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms