Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC44A4Q53GD3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms