Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CEP55Q53EZ4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP55Q53EZ4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms