Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms