Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms