Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms