Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC27Q2M243 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms