Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MICAQ29983 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MICAQ29983 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MICAQ29983 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MICAQ29983 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MICAQ29983 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MICAQ29983 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MICAQ29983 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MICAQ29983 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MICAQ29983 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MICAQ29983 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MICAQ29983 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MICAQ29983 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MICAQ29983 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MICAQ29983 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MICAQ29983 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MICAQ29983 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MICAQ29983 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MICAQ29983 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MICAQ29983 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MICAQ29983 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MICAQ29983 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MICAQ29983 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MICAQ29983 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MICAQ29983 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MICAQ29983 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MICAQ29983 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MICAQ29983 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MICAQ29983 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MICAQ29983 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MICAQ29983 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MICAQ29983 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MICAQ29983 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MICAQ29983 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MICAQ29983 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MICAQ29983 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MICAQ29983 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MICAQ29983 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MICAQ29983 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MICAQ29983 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MICAQ29983 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MICAQ29983 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MICAQ29983 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MICAQ29983 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MICAQ29983 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MICAQ29983 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MICAQ29983 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MICAQ29983 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MICAQ29983 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MICAQ29983 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MICAQ29983 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MICAQ29983 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms