Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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