Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPROQ16827 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
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