Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDUFA9Q16795 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms