Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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