Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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STX1AQ16623 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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STX1AQ16623 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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STX1AQ16623 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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STX1AQ16623 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
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