Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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