Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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