Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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