Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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