Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITSN1Q15811 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
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