Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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