Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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