Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCM1Q15154 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCM1Q15154 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms