Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KARSQ15046 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KARSQ15046 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KARSQ15046 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KARSQ15046 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KARSQ15046 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KARSQ15046 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KARSQ15046 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KARSQ15046 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KARSQ15046 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KARSQ15046 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KARSQ15046 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KARSQ15046 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KARSQ15046 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KARSQ15046 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KARSQ15046 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KARSQ15046 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KARSQ15046 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KARSQ15046 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KARSQ15046 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KARSQ15046 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KARSQ15046 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KARSQ15046 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KARSQ15046 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KARSQ15046 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KARSQ15046 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KARSQ15046 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KARSQ15046 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KARSQ15046 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KARSQ15046 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KARSQ15046 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KARSQ15046 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KARSQ15046 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KARSQ15046 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KARSQ15046 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KARSQ15046 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KARSQ15046 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KARSQ15046 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KARSQ15046 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KARSQ15046 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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