Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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