Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1I3Q14994 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms