Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFTN1Q14699 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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