Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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