Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX2Q13950 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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