Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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GTF2H3Q13889 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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GTF2H3Q13889 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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GTF2H3Q13889 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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GTF2H3Q13889 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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GTF2H3Q13889 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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GTF2H3Q13889 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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GTF2H3Q13889 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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GTF2H3Q13889 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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GTF2H3Q13889 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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GTF2H3Q13889 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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GTF2H3Q13889 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H3Q13889 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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