Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SP140Q13342 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SP140Q13342 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP140Q13342 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP140Q13342 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP140Q13342 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SP140Q13342 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP140Q13342 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP140Q13342 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP140Q13342 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP140Q13342 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP140Q13342 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP140Q13342 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP140Q13342 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP140Q13342 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP140Q13342 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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SP140Q13342 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP140Q13342 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SP140Q13342 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SP140Q13342 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SP140Q13342 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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SP140Q13342 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SP140Q13342 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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SP140Q13342 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SP140Q13342 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SP140Q13342 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SP140Q13342 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SP140Q13342 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SP140Q13342 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SP140Q13342 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SP140Q13342 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SP140Q13342 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SP140Q13342 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SP140Q13342 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SP140Q13342 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SP140Q13342 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SP140Q13342 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SP140Q13342 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SP140Q13342 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SP140Q13342 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SP140Q13342 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SP140Q13342 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SP140Q13342 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SP140Q13342 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SP140Q13342 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SP140Q13342 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SP140Q13342 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SP140Q13342 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SP140Q13342 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SP140Q13342 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SP140Q13342 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SP140Q13342 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SP140Q13342 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SP140Q13342 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SP140Q13342 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SP140Q13342 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SP140Q13342 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SP140Q13342 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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