Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms