Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TARDBPQ13148 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 27.1
TARDBPQ13148 SEPT9-215ENST00000586521 601 ntTSL 416.75■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 27.1
TARDBPQ13148 SEPT9-221ENST00000588958 879 ntTSL 215.96■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 27.1
TARDBPQ13148 SEPT9-210ENST00000585929 906 ntTSL 414.95□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 27.1
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TARDBPQ13148 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.855e-7■■■■■ 27
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TARDBPQ13148 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 26.9
TARDBPQ13148 RAP1GAP-209ENST00000471600 3238 ntTSL 511.13□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 26.9
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TARDBPQ13148 ST3GAL3-224ENST00000484868 318 ntTSL 38.92□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 26.9
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