Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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