Protein–RNA interactions for Protein: Q12330

SME1, Small nuclear ribonucleoprotein E, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SME1Q12330 GLO1YML004C 981 nt2.82□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YML047W-AYML047W-A 366 nt2.82□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YPR053CYPR053C 456 nt2.82□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YPR142CYPR142C 564 nt2.82□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt2.82□□□□□ -1.96
SME1Q12330 VTC4YJL012C 2166 nt2.82□□□□□ -1.96
SME1Q12330 RDS2YPL133C 1341 nt2.82□□□□□ -1.96
SME1Q12330 LCB4YOR171C 1875 nt2.82□□□□□ -1.96
SME1Q12330 SIZ1YDR409W 2715 nt2.81□□□□□ -1.96
SME1Q12330 RPL35BYDL136W 363 nt2.81□□□□□ -1.96
SME1Q12330 LRS4YDR439W 1044 nt2.81□□□□□ -1.96
SME1Q12330 ISC10YER180C 804 nt2.81□□□□□ -1.96
SME1Q12330 TYS1YGR185C 1185 nt2.81□□□□□ -1.96
SME1Q12330 DOG1YHR044C 741 nt2.81□□□□□ -1.96
SME1Q12330 SNX4YJL036W 1272 nt2.81□□□□□ -1.96
SME1Q12330 AHP1YLR109W 531 nt2.81□□□□□ -1.96
SME1Q12330 USB1YLR132C 873 nt2.81□□□□□ -1.96
SME1Q12330 MDV1YJL112W 2145 nt2.81□□□□□ -1.96
SME1Q12330 CIN1YOR349W 3045 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 RPN4YDL020C 1596 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 ERG9YHR190W 1335 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 RRP42YDL111C 798 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YDL186WYDL186W 834 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 KEG1YFR042W 603 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 SCM4YGR049W 564 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 PAN5YHR063C 1140 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 IGO2YHR132W-A 396 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 SOL3YHR163W 750 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 EBP2YKL172W 1284 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 TFA2YKR062W 987 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 MTD1YKR080W 963 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YNL035CYNL035C 1170 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 ASI2YNL159C 870 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 MVD1YNR043W 1191 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 TRM112YNR046W 408 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 CMD1YBR109C 444 nt2.8□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YML096WYML096W 1578 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 TSC13YDL015C 933 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YDL176WYDL176W 2127 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 NKP1YDR383C 717 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 PET54YGR222W 882 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 SDP1YIL113W 630 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 GCD14YJL125C 1152 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 COX19YLL018C-A 297 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 TRI1YMR233W 681 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 HHF2YNL030W 312 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YNL057WYNL057W 333 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 AAH1YNL141W 1044 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 RPS10AYOR293W 318 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 MRP2YPR166C 348 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YJR061WYJR061W 2808 nt2.79□□□□□ -1.96
SME1Q12330 TGL3YMR313C 1929 nt2.78□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YGL082WYGL082W 1146 nt2.78□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YGR064WYGR064W 369 nt2.78□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YHR173CYHR173C 339 nt2.78□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YMR178WYMR178W 825 nt2.78□□□□□ -1.96
SME1Q12330 YNL013CYNL013C 378 nt2.78□□□□□ -1.96
SME1Q12330 SSN8YNL025C 972 nt2.78□□□□□ -1.96
SME1Q12330 TPM1YNL079C 600 nt2.78□□□□□ -1.96
SME1Q12330 EMP70YLR083C 2004 nt2.78□□□□□ -1.96
SME1Q12330 JEN1YKL217W 1851 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 SPO14YKR031C 5052 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 CIN8YEL061C 3003 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 ECM18YDR125C 1362 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 ITT1YML068W 1395 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 CDH1YGL003C 1701 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 BUD4YJR092W 4344 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 AAD3YCR107W 1092 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YGR114CYGR114C 390 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YGR190CYGR190C 366 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YIL024CYIL024C 570 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 VMA5YKL080W 1179 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 COQ9YLR201C 783 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YMR141CYMR141C 309 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 RUF20RUF20 443 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 snR11snR11 258 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YOR114WYOR114W 885 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 PKP2YGL059W 1476 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 ARP4YJL081C 1470 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YHR080CYHR080C 4038 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 MYO5YMR109W 3660 nt2.77□□□□□ -1.97
SME1Q12330 MSH2YOL090W 2895 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 ENA5YDR038C 3276 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 ENA2YDR039C 3276 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 ENA1YDR040C 3276 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 HTA1YDR225W 399 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 THO1YER063W 657 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 AIM11YER093C-A 414 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YHR097CYHR097C 1101 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 EAF7YNL136W 1278 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 SPP381YBR152W 876 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 TFB2YPL122C 1542 nt2.76□□□□□ -1.97
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