Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms