Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms