Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms