Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM3Q08188 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms