Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms