Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EXOSC9Q06265 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EXOSC9Q06265 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms