Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.95□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 PNT1YOR266W 1272 nt2.95□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 HSH49YOR319W 642 nt2.95□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 MRPL51YPR100W 423 nt2.95□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 FLO5YHR211W 3228 nt2.95□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 SRC1YML034W 2505 nt2.94□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 TIF4631YGR162W 2859 nt2.94□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 RMD1YDL001W 1293 nt2.94□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 NIP7YPL211W 546 nt2.94□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 YPR053CYPR053C 456 nt2.94□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 ERG11YHR007C 1593 nt2.94□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 SEC59YMR013C 1560 nt2.94□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 YPK3YBR028C 1578 nt2.94□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 CIN1YOR349W 3045 nt2.94□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 MSA1YOR066W 1890 nt2.94□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 TFC1YBR123C 1950 nt2.94□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 TGL1YKL140W 1647 nt2.93□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 RRM3YHR031C 2172 nt2.93□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 YPL109CYPL109C 1974 nt2.93□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 YHL012WYHL012W 1482 nt2.93□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 CLG1YGL215W 1359 nt2.93□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 YDR340WYDR340W 303 nt2.93□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 YDR442WYDR442W 393 nt2.93□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 PEX21YGR239C 867 nt2.93□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 YMR084WYMR084W 789 nt2.93□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.93□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 YMR147WYMR147W 672 nt2.93□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 RCY1YJL204C 2523 nt2.93□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 ATG13YPR185W 2217 nt2.93□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 CEP3YMR168C 1827 nt2.93□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 NOP4YPL043W 2058 nt2.92□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 PMS1YNL082W 2622 nt2.92□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 TFC4YGR047C 3078 nt2.92□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 YGR026WYGR026W 837 nt2.92□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 YKL091CYKL091C 933 nt2.92□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 IMP1YMR150C 573 nt2.92□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 GIS4YML006C 2325 nt2.92□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 INP52YNL106C 3552 nt2.92□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 UBP8YMR223W 1416 nt2.92□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 SPP382YLR424W 2127 nt2.92□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 YTA7YGR270W 4140 nt2.91□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 DBP7YKR024C 2229 nt2.91□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 DYN2YDR424C 279 nt2.91□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 UAF30YOR295W 687 nt2.91□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 MIF2YKL089W 1650 nt2.91□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 HRD1YOL013C 1656 nt2.91□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 HER2YMR293C 1395 nt2.9□□□□□ -1.94
YMR226CQ05016 MGR3YMR115W 1506 nt2.9□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 SMT3YDR510W 306 nt2.9□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.9□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.9□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.9□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.9□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.9□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.9□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.9□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.9□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 CAB2YIL083C 1098 nt2.9□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YKR011CYKR011C 1062 nt2.9□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 ENV10YLR065C 546 nt2.9□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 HMS1YOR032C 1305 nt2.9□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 CTM1YHR109W 1758 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 CTF18YMR078C 2226 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 SMC2YFR031C 3513 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 CCT7YJL111W 1653 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 CEX1YOR112W 2286 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YCL076WYCL076W 744 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 BMH2YDR099W 822 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 RMT2YDR465C 1239 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 GPP2YER062C 753 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 ARD1YHR013C 717 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 PPA2YMR267W 933 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 IMP4YNL075W 873 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 KAP104YBR017C 2757 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 MYO5YMR109W 3660 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 AKR1YDR264C 2295 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 ESL1YIL151C 3357 nt2.89□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 EBS1YDR206W 2655 nt2.88□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 UBP5YER144C 2418 nt2.88□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 MIX14YDR031W 366 nt2.88□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YDR161WYDR161W 1164 nt2.88□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 GRX2YDR513W 432 nt2.88□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YAR075WYAR075W 474 nt2.88□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 MED11YMR112C 396 nt2.88□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 AAH1YNL141W 1044 nt2.88□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 RSM19YNR037C 276 nt2.88□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 AIM41YOR215C 558 nt2.88□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 REG1YDR028C 3045 nt2.88□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 DUF1YOL087C 3351 nt2.88□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 BNA4YBL098W 1383 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 RIM1YCR028C-A 408 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 RAD55YDR076W 1221 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YDR282CYDR282C 1245 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 PXR1YGR280C 816 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 PAN5YHR063C 1140 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 SWD2YKL018W 990 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 HNT3YOR258W 654 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YBR116CYBR116C 528 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YMR1YJR110W 2067 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 NMD2YHR077C 3270 nt2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.6 ms