Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms