Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms